BioSample validator入力ファイル形式拡張方針の検討

[tfuji]

• 基本的にはhandsontableのgetData()が返すJSON形式が入力。配列の配列 or ハッシュの配列
• biosample/bioproject のsubmission_id/submitter_idが不在が前提で内部PostgreSQLへの接続をしない
• 上記に関連するルールのwarning/errorをスキップもしくはレスポンスとして出力しない
• xpath出力部分は要相談
• XmlConvertorクラスに相当する JsonConverterクラスを実装し、xml変換オブジェクトと同等に変換
• BioSampleValidator::validate_externalの実装
  • JSON入力に対応
  • biosample/bioproject のsubmission_id/submitter_id関連ルールの対応
• BioSampleValidator::validate_externalからの再利用を目的とした BioSampleValidator::validate をリファクタリング

[okbp]

validationAPIにパラメータ"executer"を入力することでDDBJ DBを使用するルールを無視する実装を追加
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JSONファイルを受け付けるように追加実装
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